股东出资纠纷诉讼时效一般为三年。根据《中华人民共和国民法典》规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。

在股东出资纠纷中，诉讼时效从知道或者应当知道权利被侵害时起计算。比如公司发现股东未按约定出资，此时诉讼时效开始起算。但如果存在一些特殊情况，如在这三年中，公司一直在向该股东主张出资责任等导致诉讼时效中断的情形，那么诉讼时效会重新计算。中断的事由包括债权人向债务人提出履行请求、债务人同意履行义务等。所以，股东出资纠纷中，要密切关注诉讼时效，及时主张权利，维护自身合法权益。

股东出资纠纷管辖法院的确定有以下规则：

首先，根据《民事诉讼法》规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。

在股东出资纠纷中，“合同履行地”有其特殊性。一般认为，公司住所地可视为股东出资合同的履行地。

所以，通常情况下，股东出资纠纷案件，被告住所地法院和公司住所地法院都有管辖权。

若双方在合同中对管辖法院有明确约定，且该约定不违反级别管辖和专属管辖规定的，从其约定。

需注意，具体案件中要准确判断被告住所地及合同履行地等关键要素，以确定具体的管辖法院，保障当事人合法权益，确保诉讼程序顺利进行。